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珍珠粉，不管是海水的还是淡水的，其主要化学成分都是碳酸钙，另外还含有多种氨基酸和多种微量元素等。
在物理结构上，两种珍珠粉的矿物组成都比较单一，主要由文石构成。
由于养殖环境和珍珠贝品种的不同，淡水珍珠（粉）和海水珍珠（粉）的所含元素会有所差异：海水珍珠（粉）富含钠、钾、镁和锶，淡水珍珠（粉）富含锰。这种珍珠（粉）中元素的富集特征与淡水、海水中元素的富集特征相似。
（参考中国地质大学珠宝学院李立平教授的论文《海水及淡水养殖珍珠的物质组成》）
另外，淡水珍珠粉有3种氨基酸含量比海水珍珠粉的低，有2种与之持平，余下13种氨基酸的含量较海水珍珠粉更高。
（《中国药学杂志》1989年第5期313，翁林福等对淡水珍珠粉和海水珍珠粉的化学成份进行了分析比较，分析结果表明，淡水珍珠和海水珍珠的化学成份基本一致）
虽然实验数据上有所差异，但在一般的日常生活保健应用中，相同剂量的珍珠粉在使用效果上，淡水珍珠粉与海水珍珠粉并没有表现出多明显的的差异。（或者说两者在实际使用效果上的区别可以忽略不计）
至于在一些精细的生化试验或者在医学研究中，如果需要对指定有效成分的含量进行精确计算并做对比试验，可能就要讲究是用海水珍珠粉还是用淡水珍珠粉。
平时不少人痴迷于海水珍珠粉，主要是受到“大海”自带的神秘感所影响。
从理性消费角度看，只要是货真价实，哪种性价比高就买哪种就好。对于一些迷之喜欢海水珍珠粉的，就当作是享受生活，开心就好。
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