1986年,中山医科大学派出以梅骅教授为首的医疗团队支援深圳特区卫生事业,组建了中山医科大学深圳医疗中心。1997年升级为中山医科大学深圳泌尿外科医院。同年,“中国试管婴儿之父”中山医科大学庄广伦教授在本院创建深圳首家试管婴儿中心,也是首批获得卫生部门批准实施辅助生殖技术的生殖医学中心之一,最早为深圳市民提供第一代和第二代试管婴儿技术服务。2003年因中山大学与中山医科大学合并,医院改制并更名为深圳中山泌尿外科医院。医院以用精湛的医术和高度的责任感承载生命为己任,致力于建设以生殖医学为主体,具有领先技术、现代化、区域性的专科医院。
医院现有职工共424人,临床医务人员222人,其中54人拥有硕博士学位。我院为中华医学会生殖医学分会常委及广东省医学会生殖医学分会副委单位,生殖医学中心试管婴儿成功率65%,保持国内先进水平,已连续举办五届国际生殖免疫新进展学术研讨会。
近年来,医院先后获得省市重点实验室、工程中心及博士后创新实践基地,获国家、省市级科研课题56项,科研经费3000余万元,发表科研论文465篇,其中SCI论文近60篇。荣获深圳市科技进步一等奖和中华医学科技进步奖二等奖。连续十余年被评为深圳市医保信用等级AAA单位。